警告：《星际迷航：下层甲板》结局剧透 – “下一代”星际迷航：下层甲板该系列的结局以他们自己版本的动画喜剧《深空九号》的创作结束。塞里托斯号是行星联合联邦中唯一一艘能够阻止致命孤子波毁灭的宇宙飞船。 星际迷航主要时间线。最终，通往无限量子现实的新稳定门户被打开，并且 只有一个星际基地可以保护这个虫洞免受多元宇宙的影响。
星际迷航：深空九号在最初的任务中，空间站在指挥官（后来的船长）本杰明·西斯科（艾弗里·布鲁克斯饰）的领导下，从贝久运来，负责守卫伽玛象限的一个虫洞。虫洞被贝久人称为天空圣殿，是他们的众神先知的家园，是通往世界未知区域的通道。 星际迷航星系。即使在伽玛象限的统治者自治领叛逃到阿尔法象限并对联邦宣战之后， 深空九号依然坚守在虫洞门口的岗位上。
Starbase 80 是《星际迷航：新九层深空下层甲板》
最糟糕的星际基地现在担负着星际舰队最重要的使命
星际迷航：下层甲板《终局之战》现在将多元宇宙带入游戏，为无限数量的替代宇宙创建了一个稳定的门户。就像深空九号和伽玛象限中的贝久虫洞一样，星际舰队建立了一个新的使命来守卫这个多元宇宙门户并探索各种量子现实。由于门户的危险的快子辐射，只有一个星际基地的系统足够老，可以幸免。因此， Starbase 80，以前被称为联邦最差的星际基地，现在守卫着传送门。
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卡罗尔·弗里曼船长（唐·刘易斯饰）被任命领导星际舰队的多元宇宙探索任务，她是塞里托斯号航空母舰的前船长。 星际迷航：下层甲板相当于本杰明·西斯科上尉。 星际迷航：下层甲板 在第五季中揭晓之前，花了几季的时间创造了不受欢迎的 Starbase 80，但是 动画喜剧的结局总是会给 星际迷航：下层甲板 你自己的深空九号版本就像塞里托斯继承了衣钵一样 星际迷航：下一代USS Enterprise-D 和 E。
《星际迷航：Starbase 80 下层甲板》也有自己的 USS Defiant，就像 DS9 一样
阿那克西曼德星舰将大胆前往前人未曾去过的地方
星际迷航：深空九号 随着第 3 季中美国海军挑战号的引入，创造了新的故事可能性并升级 DS9 与另一艘星舰 星际迷航 排。 Starbase 80 是深空九号的一个版本，这并非巧合。 星际迷航：下层甲板 第五季第九集“裂痕探索”介绍了阿那克西曼德号，这是一艘由威廉·博伊姆勒船长（杰克·奎德饰）领导的挑战级星舰。 阿那克西曼德完成 星际迷航：下层甲板'更新 深空九号公司的理念和使命。
希望有一天我们能看到 Starbase 80 任务发生了什么。
这也对应于替代现实版本。 星际迷航：深空九号朱利安·巴希尔博士（亚历山大·西迪格饰）和埃利姆·加拉克（安德鲁·罗宾逊饰）是阿那克西曼德号的船员（并且是一对夫妇）。虽然，不幸的是 星际迷航：下层甲板平行现实柯松·达克斯（弗雷德·塔塔西奥饰）没能活着看到多元宇宙的稳定门户。随着美国海军塞里托斯号以新的指挥结构开始新的航行， 星际迷航：下层甲板 还以自己的深空九号结束，希望有一天我们能看到 Starbase 80 任务发生了什么。