A atitude despreocupada de Supergirl pode estar escondendo seu segredo mais sombrio de todos os tempos. Enquanto Kara lutava para se lembrar de sua vida antes de vir para a Terra, ela descobriu uma memória que revelou que ela foi realmente enviada à Terra em uma missão para matar seu primo infantil, Kal-El.
Durante anos, Superman foi o único kryptoniano em todo o Universo DC e nunca teve uma conexão com seu mundo natal. Isso mudou quando um foguete veio à Terra e revelou outro sobrevivente da destruição de Krypton: uma jovem que por acaso era seu parente de carne e osso. Superman e sua prima Supergirl se uniram instantaneamente por causa de sua conexão familiar e perdas maciças. Embora fosse difícil para Kara se ajustar ao novo mundo ao seu redor, Clark a ajudou a se acostumar e a colocou no caminho para se tornar a heroína que seus novos poderes permitiram que ela fosse.
Infelizmente, parecia que Kara estava guardando um segredo obscuro, um que até ela esqueceu. Dentro Supergirl #4 por Jeph Loeb e Ian Churchill, Kara foi exposta à Kryptonita negra por Lex Luthor, que esperava trazer à tona a suposta verdadeira natureza de Supergirl. Em vez disso, Luthor acaba criando uma sósia maligna de Kara que usa uma fantasia alternativa de Supergirl. Dark Supergirl ataca Luthor e começa a causar estragos na lua. A verdadeira Supergirl confronta seu clone, mas Dark Supergirl começa a contar uma história sobre como ela é a verdadeiro Cara. Segundo ela, a “legal” Supergirl é na verdade o resultado do condicionamento de um programa que seu pai Zor-El havia criado. Ele precisava que Kara não levantasse suspeitas e ganhasse a confiança daqueles que observavam o primo de Kara na Terra. Quando ela finalmente tivesse, ela faria o que ela realmente foi enviada para a Terra: matar o bebê Kal-El.
Deve-se notar que essa mudança extremamente controversa na origem de Supergirl foi objeto de debate por várias questões. Enquanto a mudança que Loeb fez no passado de Kara foi explorada por vários outros escritores, acabou sendo retransmitida para sempre em Supergirl #35. Aparentemente, Kara estava sofrendo de envenenamento por kryptonita que estava afetando sua memória, fazendo com que ela criasse falsas e esquecesse completamente outras. É bom saber que a Supergirl não foi feita para matar sua prima, mas é curioso como essa memória se manifestou.
A primeira vez que Kara ouviu essa mudança em sua história foi de uma versão completamente maligna de si mesma criada por kryptonita negra. Obviamente Supergirl ama o Superman e não sonharia em machucá-lo, mas ouvir tal coisa de si mesma foi o suficiente para plantar a dúvida em sua cabeça. E não ajudou que Kara não pudesse se lembrar de seu passado claramente, apenas adicionando combustível ao fogo que seu doppelganger começou. Supergirl mostrou lutar contra a raiva, um problema exacerbado por seu conflito com a cultura da Terra. Com Kal-El se encaixando tão facilmente na Terra, é possível que sua raiva tenha formado uma falsa memória que visava Clark?
Deve ser assim, pois Supergirl nunca machucaria o Superman, não importa quais mudanças sejam feitas em sua origem.