A primeira vitória de Yugi em Duel Monsters em Yu-Gi-Oh! tornou-se um momento icônico dentro do fandom de anime (especialmente o final), mas enquanto Yugi foi vitorioso, vencer aquele duelo foi na verdade o maior erro que ele poderia ter cometido.
No primeiro episódio de Yu-Gi-Oh!, Yugi desafia Seto Kaiba para um duelo depois que Kaiba derrotou o avô de Yugi, Solomon. Kaiba duelou com Solomon para colocar as mãos no Dragão Branco de Olhos Azuis do velho, completando assim o conjunto de quatro de Kaiba (antes de Kaiba rasgá-lo, de qualquer maneira). Para vingar a perda de seu avô – e subsequente ataque cardíaco – Yugi desafiou Kaiba para um duelo onde ele derrotou todos os três Dragões Brancos de Olhos Azuis de Kaiba com Exodia. Yugi conseguiu ensinar uma lição a Kaiba, mas o preço que ele pagaria por aquela vitória final definitivamente não valeria a pena.
A vitória de Yugi sobre Kaiba em Yu-Gi-Oh! arruinou a vida dele
Em Yu-Gi-Oh! episódio 9 (escrito por Junki Takegami, Masashi Sogo e Shin Yoshida, e dirigido por Kunihisa Sugishima), Yugi está enfrentando Kaiba novamente pela primeira vez desde que o derrotou no episódio 1, mas algo está diferente nele. Este Kaiba é mais sombrio, mais frio e, em geral, mais sinistro. O Kaiba original não era nenhum escoteiro, mas este não tinha mais nenhum pingo de bondade nele. Como Yugi logo aprenderia, isso ocorre porque o Kaiba que ele estava enfrentando não era realmente Kaiba, mas o mal encarnado que foi expulso de Kaiba, conhecido como Ghost Kaiba. Durante o primeiro duelo de Yugi contra Kaiba, Yami Yugi separou a parte boa da alma de Kaiba da má, e ele enviou a parte ruim dele para o Shadow Realm, onde Pegasus encontrou Ghost Kaiba e o usou contra Yugi neste episódio.
Ao derrotar Kaiba no episódio 1, Yugi literalmente cria um vilão que é muito pior do que o original – mas isso não é tudo. Cada momento da vida de Yugi após sua vitória sobre Kaiba é repleto de miséria e dificuldades. Ao derrotar Kaiba, Yugi se coloca no radar de Pegasus, o que leva o vilão a descobrir que Yugi tem o cobiçado Enigma do Milênio. Não apenas isso, mas Pegasus então rouba a alma de Solomon em uma trama elaborada para colocar as mãos no Enigma do Milênio. Se Yugi nunca vencesse Kaiba, Pegasus não saberia quem ele era e sua família estaria segura. Além de criar vilões piores ao derrotar Kaiba, o deck de Yugi também é afetado negativamente por tudo isso. Yugi começou com um Dragão Branco de Olhos Azuis (tecnicamente de seu avô, mas ainda disponível para ele) e todas as cinco cartas Exodia. Depois de encontrar Kaiba, o Dragão Branco de Olhos Azuis é dilacerado e Exodia é jogada no mar por Weevil.
No início da série, Yugi tinha as melhores cartas, já estava junto com Yami Yugi através do Enigma do Milênio e dominava o Coração das Cartas. Basicamente, Yugi já era o melhor antes mesmo de a série começar, mas depois de vencer Kaiba, ele se deparou com um evento infeliz após o outro – provando que o primeiro de Yugi Yu-Gi-Oh! ganhar foi na verdade um grande erro.