Nenhuma dessas coisas são “divergências” do MCU, e ter uma narrativa separada não significa “não canônica”.
o programa simplesmente não mencionou o Snap/blip, mas não mencionar algo não é prova de que isso não aconteceu. A estrutura era uma simulação computacional, não tenho ideia de por que isso seria algum tipo de prova de que o programa divergia do MCU. E só porque os filmes não reconheceram coisas como o retorno de Coulson ou os Inumanos não prova seu status não canônico, e nem o fato de não haver nenhum crossover ainda nas coisas mais recentes. Talvez um dia a Marvel decida reconhecê-los com um crossover, ou talvez não, mas a única coisa que tornaria os programas “não canônicos” é se eles reintroduzissem elementos ou personagens do programa de uma forma que explicitamente tornasse o programa impossível.