Uma torção escura em Smallville a segunda temporada deu a entender que Clark estava realmente certo sobre Jor-El ser mau. Nas primeiras temporadas do programa, os Kents temiam os planos que o pai biológico de Clark tinha para ele. Mas com o passar do tempo, as percepções de Jor-El começaram a mudar.
A determinação de Jor-El em fazer o Clark de Tom Welling aceitar seu destino e sua herança kryptoniana foi uma das maiores preocupações de Clark durante seus anos de colégio em Smallville. Desejando viver sua própria vida, Clark lutou contra Jor-El por anos, mas acabou ouvindo com relutância os conselhos de Jor-El. Foram as palavras de Jor-El que ajudaram Clark a parar a segunda chuva de meteoros na 4ª temporada, reviver Lana Lang e parar o General Zod na 5ª temporada. Graças em parte a essas experiências, Clark lentamente percebeu que havia interpretado mal as intenções de Jor-El. Na verdade, Jor-El estava tentando guiar Clark para se tornar uma força do bem na Terra.
Uma reviravolta na segunda temporada de Smallville sugeriu que Jor-El realmente era mau
Curiosamente, o que Clark passou a acreditar sobre Jor-El contradiz um detalhe importante de Smallville “Rosetta” da 2ª temporada. Usando a chave octogonal, Clark destrancou sua nave e descobriu uma mensagem escondida deixada por seu pai. Chamando-o de “deus entre os homens”, Jor-El instruiu Clark a “governá-los com força.” Foi essa revelação que fez Clark se preocupar com o fato de Jor-El querer que ele usasse seus poderes para conquistar a Terra. Dadas as palavras da mensagem, as suspeitas de Clark pareciam bem fundamentadas na época.
Clark acabou por estar errado sobre Jor-El, mas era completamente compreensível para ele suspeitar do pior sobre Jor-El. A mensagem encontrada na 2ª temporada assumiu que Jor-El era mau, uma conclusão lógica para Clark chegar. Afinal, parecia de Smallville enfrentar Jor-El esperava que Clark governasse os humanos. Sua escolha de palavras deixou pouco espaço para qualquer outro significado ser encontrado. Como Smallville seguiu em frente e revelou mais sobre o verdadeiro plano de Jor-El, nunca voltou a essa reviravolta ou ofereceu uma interpretação diferente, o que reforça a ideia de que o programa queria que ele fosse um vilão.
Como Jor-El sendo um vilão teria mudado a história de Smallville
Jor-El teve uma presença antagônica na segunda e terceira temporadas, mas o show evitou transformá-lo em um vilão de pleno direito. Mas se o programa tivesse seguido a reviravolta da segunda temporada, é provável que as coisas tivessem acontecido de maneira muito diferente para Clark conforme sua história se desenvolvia, particularmente em Smallville temporadas posteriores. Virar as costas para Jor-El para sempre teria visto Clark abrir um caminho completamente independente da orientação da IA. Isso significaria que Clark nunca construiria a Fortaleza da Solidão ou começaria seu treinamento kryptoniano. O quão grande mudança isso teria sido na fórmula do Superman pode ser a razão pela qual Smallville mudou de direção com Jor-El.